СИНТЕЗ И МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЯ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ, НЕСУЩИХ ТИОФОСФОРИЛЬНЫЕ МОДИФИКАЦИИ ЗАДАННОЙ ЛОКАЛИЗАЦИИ

© 2008 г. Т. А. Лукьянова, М. А. Зайцева, В. А. Карпов, Г. Е. Позмогова^#

^#Тел.: (495) 246-43-10; e-mail: [email protected]

Федеральное государственное учреждение «НИИ физико-химической медицины Росздрава», 119992, Москва, ул. Малая Пироговская, 1а

Поступила в редакцию 11.01.2007 г. Принята к печати 20.03.2007 г.

Оптимизированы приемы параллельного автоматического синтеза олигонуклеотидов, несущих различные локальные тиофосфорильные межнуклеотидные связи, с использованием сборки в «ждущем режиме» и с созданием специальных программных блоков. Подобраны условия лазерной десорбционно-ионизационной масс-спектрометрии с участием матрицы (MALDI-TOF), позволившие повысить чувствительность метода (1–10 фмоль олигонуклеотида в пробе) и получать достоверные спектры тиофосфорильных аналогов олигонуклеотидов, что создает возможность надежно доказывать наличие заданного числа тиофосфорильных связей в составе синтетических последовательностей. Получен ряд олигодезоксирибонуклеотидов – тиоаналогов известного G-квадруплексного антитромбинового аптамера – d(GGTTGGTGTGGTTGG).

Ключевые слова: олигонуклеотиды, тиофосфорильные аналоги, автоматический синтез, масс-спектрометрия.

Биоорг. химия 2008, 34(1): 83-88