СИНТЕЗ И СВОЙСТВА МОДИФИЦИРОВАННЫХ ДНК-ФРАГМЕНТОВ С ВКЛЮЧЕНИЯМИ ТИМИДИНГЛИКОЛЯ

© 2008 г. Е. А. Федотова*, Ф. Ян*, Е. А. Кубарева**^#, Е. А. Романова**, А. С. Проценко***, М. Б. Вирясов*, Т. Гианик****, Т. С. Орецкая*

^#Тел.: (495) 939-31-48; факс: (495) 939-31-81; e-mail: [email protected]

*Химический факультет и **НИИ физико-химической биологии им. А.Н. Белозерского Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова, Москва, Воробьевы горы;
***Пущинский государственный университет, Институт биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина, 142290, г. Пущино Московской обл.;
****Университет Коменского, Братислава, Словакия

Поступила в редакцию 26.04.2007 г. Принята к печати 16.05.2007 г.

Описан химический синтез набора модифицированных олигодезоксирибонуклеотидов, содержащих один или два остатка тимидингликоля (5,6-дигидро-5,6-дигидрокситимидина) – основного продукта окислительного повреждения ДНК. Методом УФ-спектроскопии изучена термическая устойчивость ДНК-дуплексов с включениями остатков тимидингликоля. Показано, что введение даже одного остатка тимидингликоля в состав дуплекса приводит к его существенной дестабилизации. Впервые получены данные о взаимодействии ДНК-метилтрансфераз и эндонуклеаз рестрикции типа II с ДНК-лигандами, содержащими в своем составе окисленный остаток тимина. Установлено, что введение в центральную вырожденную позицию участка узнавания эндонуклеазы рестрикции SsoII остатка тимидингликоля приводит к повышению начальной скорости гидролиза модифицированного дуплекса по сравнению с немодифицированным, а сродство С5-цитозиновой метилтрансферазы SsoII к ДНК-дуплексу с тимидингликолем в 2 раза выше, чем к немодифицированному субстрату. Однако такая модификация ДНК-лиганда препятствует его метилированию.

Ключевые слова: тимидингликоль, модифицированные олигонуклеотиды, ДНК-метилтрансфераза SsoII, эндонуклеаза рестрикции SsoII.

Биоорг.химия 2008, 34(2): 236-244