АНАЛОГИ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ, СОДЕРЖАЩИЕ МЕЖНУКЛЕОТИДНУЮ СВЯЗЬ C3'-NH-CO-CH2-N(CH3)-C5'
© 2008 г. С. В. Кочеткова, Н. А. Колганова, Э. Н. Тимофеев, В. Л. Флорентьев#
#Тел.: (499) 135-21-82, (499) 135-65-91; факс: (499) 135-14-05; e-mail: [email protected]
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, 119991, Москва, ул. Вавилова, 32
Поступила в редакцию 06.06.2007 г. Принята к печати 05.07.2007 г.
Синтезированы аналоги олигонуклеотидов, межнуклеозидное звено которых содержит амидную связь и метиламиногруппу (С3'-NH-CO-CH2-N(CH3)-С5'). Измерены кривые плавления дуплексов, образованных модифицированными и комплементарными им природными олигонуклеотидами, рассчитаны температуры плавления и термодинамические параметры образования дуплексов. Введение в олигонуклеотид одного модифицированного динуклеозидного звена вызывает лишь небольшое снижение температуры плавления таких дуплексов в сравнении с немодифицированными. Изучены КД-спектры модифицированных дуплексов, обсуждается их пространственное строение.
Ключевые слова: олигонуклеотиды, аналоги, амидная межнуклеотидная связь, гибридизация, термическая стабильность.