ГЕНОМНАЯ БЛИЗОСТЬ БАЙКАЛЬСКОГО ОМУЛЯ И СИГА
© 2009 г. О. С. Быченко*, Л. В. Суханова**, С. С. Уколова*, Т. А. Скворцов*, В. К. Потапов*, Т. Л. Ажикина*#, Е. Д. Свердлов*
#Тел.: (495) 330-65-47; факс: (495) 330-65-38; e-mail: [email protected]
*Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, 117997 ГСП, Москва, В-437, ул. Миклухо-Маклая, 16/10; **Лимнологический институт СО РАН, Иркутск
Поступила в редакцию 20.03.2008 г. Принята к печати 28.05.2008 г.
Два представителя байкальских сиговых – озерный сиг (Coregonus lavaretus baicalensis Dybovsky) и омуль (C. autumnalis migratorius Georgi) являются ближайшими родственниками, их дивергенция от общего предка произошла всего 10–20 тыс. лет назад. Работа посвящена исследованию геномного полиморфизма этих двух видов рыб. Использование метода вычитающей гибридизации (ВГ) между геномными ДНК сига и омуля не выявило протяженных последовательностей, присутствующих в геноме сига и отсутствующих в геноме омуля. Все найденные в результате ВГ фрагменты соответствуют полиморфным некодирующим участкам геномов, варьирующим в результате однонуклеотидных замен и коротких делеций. Многие из них картируются вблизи генов иммунной системы и имеют участки, идентичные широко распространенным среди рыб Тс1-подобным транспозонам, транскрипционная активность которых может влиять на экспрессию близлежащих генов. Таким образом, нами впервые показано, что генетические различия между байкальскими сиговыми чрезвычайно малы и не выявляются методами ВГ. Это еще раз подтверждает предположение о близком родстве байкальских омуля и сига и их эволюционно недавнюю дивергенцию от общего предка.
Ключевые слова: видообразование, геномный полиморфизм, Coregonidae, вычитающая гибридизация.