СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ НОВЫХ НЕНУКЛЕОЗИДНЫХ СУБСТРАТОВ C ТЕРМИНАЛЬНОЙ ДЕЗОКСИНУКЛЕОТИДИЛТРАНСФЕРАЗОЙ

© 2009 г. Е. С. Матюгина*, Л. А. Александрова*, М. В. Ясько*, А. В. Иванов*, И. А. Васильев*, В. Л. Лаптева**, А. Л. Хандажинская*^#, М. К. Куханова*

^#Тел.: (499) 135-22-55; факс: (499) 135-14-05; e-mail: [email protected]

*Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, 119991, Москва, ул. Вавилова, 32;
**Химический факультет МГУ, Москва, Воробьевы горы, 1

Поступила в редакцию 11.07.2008 г. Принята к печати 05.08.2008 г.

Синтезированы и изучены в качестве субстратов терминальной дезоксинуклеотидилтрансферазы новые ненуклеозидные эфиры трифосфорной кислоты, содержащие различные гидрофобные группы: (1) N-(2-триптиценкарбонил)-4-аминобутильную; (2) 5-фенилзамещенную N-(2,4-динитрофенил)-4-аминобутильную; (3) N-(4-фенилбензоил)- и N-(4-(N-бензиламино)бензоил)-2-аминоэтильные группы; а также (4) дифенилметильную и флуоренильную. Все соединения, за исключением двух последних, обладали субстратными свойствами и включались в 3’-конец дезоксиолигонуклеотида. На основании биохимических экспериментов и компьютерного моделирования показано, что для проявления субстратных свойств необходимо наличие линкера между трифосфатным и гидрофобным фрагментами молекулы.

Ключевые слова: терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза, ненуклеозидные субстраты, субстратные свойства, производные трифосфатов.

Биоорг.химия 2009, 35 (3): 376-383