АНАЛОГИ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ, СОДЕРЖАЩИЕ МЕЖНУКЛЕОТИДНУЮ СВЯЗЬ C3'–NH–C(O)–CH₂–C5'

© 2010 г. А. М. Варижук, С. В. Кочеткова, Н. А. Колганова, Э. Н. Тимофеев, В. Л. Флорентьев^#

^#Тел.: 499-135-21-82, 499-135-65-91; факс: 499-135-14-05; e-mail: [email protected]

Учреждение Российской академии наук Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, 119991, Москва, ул. Вавилова, 32

Поступила в редакцию 24.03.2009 г. Принята к печати 18.05.2009 г.

Взаимодействием 3'-O-бензил-2'-O-трет-бутилдиметилсилил-5'-дезокси-5'-карбоксиметилрибозилтимина, полученного из 2'-O-ацетил-3'-O-бензил-5'-дезокси-5'-этоксикарбонилметилрибозилтимина метанолизом ацетильной группы с последующим силилированием освободившегося гидроксила и, наконец, омылением сложного эфира, с 3'-дезокси-3'-амино-5'-O-(трет-бутилдиметилсилил)тимидином синтезирован динуклеозид с амидной межнуклеотидной связью С3'–NH–C(O)–CH₂–С5'. После манипуляции защитными группами динуклеозид был превращен в 3'-O-(2-цианэтил-N,N-диизопропилфосфорамидит), который был использован для синтеза модифицированных олигонуклеотидов на автоматическом синтезаторе. Измерены кривые плавления дуплексов, образованных модифицированными и комплементарными им природными олигонуклеотидами, рассчитаны температуры плавления и термодинамические параметры образования дуплексов. Введение в олигонуклеотид одной модифицированной связи вызывает лишь незначительное снижение температуры плавления таких дуплексов в сравнении с немодифицированными.

Ключевые слова: олигонуклеотиды, аналоги, амидная межнуклеотидная связь, гибридизация, термическая стабильность.

Биоорг.химия 2010, 36 (2): 215-222