Письмо Редактору

НОВЫЙ КЛАСС МОДИФИЦИРОВАННЫХ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ С ПЕПТИДНОЙ МЕЖНУКЛЕОТИДНОЙ СВЯЗЬЮ

© 2010 г. А. М. Варижук, С. В. Кочеткова, Н. А. Колганова, Э. Н. Тимофеев, В. Л. Флорентьев^#

^#Тел.: 499-135-21-82, 499-135-65-91; факс: 499-135-14-05; e-mail: [email protected]

Учреждение Российской академии наук Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, 119991, Москва, ул. Вавилова, 32

Поступило в редакцию 29.01.2010 г. Принято к печати 08.02.2010 г.

Синтезированы аналоги олигонуклеотидов, в которых одна или несколько фосфодиэфирных межнуклеотидных связей заменены на остаток глицина, L- и D-аланина. (С3'–NH–C(O)–CH(X)–NH–С(O)–C4', где X = H, (S)-CH₃ и (R)-CH₃.) Изучена стабильность дуплексов, образованных модифицированными олигонуклеотидами c комплементарными им природными матрицами. Показано, что включение в межнуклеозидные связи остатков глицина и L-аланина заметно снижает стабильность модифицированных дуплексов по сравнению с природными (Т_пл ~ –2°С на одну модификацию), тогда как аналоги с D-аланинсодержащими линкерами образуют дуплексы повышенной стабильности (ΔТ_пл ~ +0.2°С на одну модификацию).

Ключевые слова: олигонуклеотиды, аналоги, синтез, пептидная межнуклеотидная связь, гибридизация, термическая стабильность.

Биоорг.химия 2010, 36 (4): 570-572