ЯМР-ИССЛЕДОВАНИЕ СТРУКТУРЫ И ДИНАМИКИ ХИМЕРНОГО БЕЛКА SHA-D CЕМЕЙСТВА «SH3-БЕРЖЕРАК»

© 2010 г. В. С. Христофоров*, Д. А. Прохоров*, М. А. Тимченко*, Ю. А. Кудреватых*, Л. В. Гущина**, В. В. Филимонов**, В. П. Кутышенко*^#

^#Тел.: (4967) 73-92-26; факс: (4967) 33-05-53; e-mail: [email protected]

*Учреждение Российской академии наук Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН, 142290, Московская обл., Пущино, ул. Институтская, 3;
**Учреждение Российской академии наук Институт белка РАН, Московская обл., Пущино

Поступила в редакцию 16.12.2009 г. Принята к печати 29.01.2010 г.

Методом спектроскопии ЯМР высокого разрешения проведено структурно-динамическое исследование одного из химерных белков (SHA-D) семейства «SH3-Бержерак», у которого β-поворот N47–D48 в спектриновом SH3-домене заменен на последовательность KATANDKTYE. На основе данных ЯМР определена пространственная структура белка и исследована ее динамика в растворе. Удлинение полипептидной цепи SHA-D по сравнению с исходным белком WT-SH3 (~17%) практически не отражается на общей топологии молекулы. ЯМР-структура белка SHА-D почти полностью идентична структурам других представителей семейства «SH3-Бержерак», но имеются определенные отличия в динамических характеристиках в месте вставки. Замена G52D в β-повороте SHA-D приводит к дестабилизации вставки, в которой возникают условия для конформационного обмена. Эта дестабилизация транслируется на всю молекулу SHA-D, структура которой становится более лабильной.

Ключевые слова: SH3-домен, белок SHA-D семейства «SH3-Бержерак», пространственная структура, динамика, ЯМР.

Биоорг.химия 2010, 36 (4): 505-513