ДИФФЕРЕНЦИРОВКА α-ГЕМОЛИТИЧЕСКИХ СТРЕПТОКОККОВ ПРЯМЫМ МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЧЕСКИМ ПРОФИЛИРОВАНИЕМ

© 2011 г. А. Д. Боровская*, Е. Н. Ильина*^#, Т. А. Савинова²*, С. В. Сидоренко²*^,3*, С. А. Грудинина⁴*, В. М. Говорун*^,5*

^#Тел.: (499) 245-04-71; e-mail: [email protected]

*ФГУ НИИ Физико-химической медицины ФМБА России, Москва, 119435, Малая Пироговская, 1а;
²*Национальное агентство клинической фармакологии и фармации, Москва;
³*ФГУ НИИ Детских инфекций ФМБА России, Санкт-Петербург;
⁴*ФГУП Государственный научный центр по антибиотикам, Москва;
⁵*Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Москва

Поступила в редакцию 12.07.2010 г. Принята к печати 12.08.2010 г.

Существующие фенотипические и генетические методы (за исключением мультилокусного сиквенс-типирования) не позволяют надежно дифференцировать α-гемолитические стрептококки группы Mitis. В настоящем исследовании получены MALDI-масс-спектры 28 изолятов, изначально идентифицированных стандартными методами как Streptococcus pneumoniae. Полученное в ходе кластеризации масс-спектрометрических профилей распределение изолятов согласуется с данными мультилокусного типирования, установившего принадлежность исследованных изолятов к двум близкородственным видам – S. pneumoniae и S. mitis. На основе генетического алгоритма построена классификационная модель, дифференцирующая α-гемолитические стрептококки со 100% чувствительностью и 94.6% специфичностью. Согласно анализу статистических диаграмм площадей, выявлены два пика, отличающие группу изолятов S. mitis от S. pneumoniae.

Ключевые слова: бактериальные белки; протеома; мультилокусное секвенирование; видовая идентификация, Streptococcus pneumoniae.