НОВЫЙ МЕТОД НОРМИРОВКИ ВРЕМЕН ЭЛЮИРОВАНИЯ ПЕПТИДОВ В ХРОМАТОМАСС-СПЕКТРОМЕТРИЧЕСКИХ ЭКСПЕРИМЕНТАХ

© 2011 г. Д. М. Автономов, И. А. Агрон, А. С. Кононихин, И. А. Попов, Е. Н. Николаев^#

^#Тел.: (495) 939-73-70; факс: (495) 939-73-70; e-mail: [email protected]

Учреждение РАН Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля, 119334, Москва, ул. Косыгина, д. 4

Поступила в редакцию 09.08.2010 г. Принята к печати 16.08.2010 г.

При проведении протеомных исследований с применением масс-спектрометрии возникает необходимость в сравнении экспериментальных данных между собой (например, контроль с патологией, меченый образец с немеченым). Если для идентификации пептидов в разных экспериментах пользоваться лишь их точно измеренными массами и временами удерживания в хроматографической колонке, возникают трудности с идентификацией хроматографических пиков, принадлежащих одинаковым веществам, в разных хроматограммах (нормировка хроматограмм по времени). При неизбежном различии условий хроматографических экспериментов (замена хроматографических колонок, небольшие изменения потока мобильной фазы или концентрации растворителя и т.д.), времена удерживания одних и тех же пептидов будут разниться от эксперимента к эксперименту. Нами предлагается надежный метод, позволяющий отобрать пики из хроматомасс-спектрограмм, соответствующие одинаковым пептидам, для последующей нормировки времен удерживания (как линейной, так и любой другой монотонной функции).

Ключевые слова: протеомика; масс-спектрометрия; хроматография; выравнивание времен удерживания; метод точных массово-временных меток.