Письмо Редактору

МЕТОД ОПРЕДЕЛЕНИЯ ТРЕХМЕРНОЙ СТРУКТУРЫ ФЛУОРЕСЦЕНТНЫХ БЕЛКОВ ПРИ ПОМОЩИ ГОМОЛОГИЧНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ И МАСС-СПЕКТРОМЕТРИИ

© 2011 г. А. А. Пахомов^#, В. И. Мартынов

^#Тел.: (495) 336-51-11; факс: (495) 336-61-66; e-mail: [email protected]

Учреждение Российской академии наук Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, 117997 ГСП, Москва, В-437, ул. Миклухо-Маклая, 16/10

Поступило в редакцию 19.11.2010 г. Принято к печати 29.11.2010 г.

В работе представлен метод установления пространственной структуры GFP-подобных флуоресцентных белков. Метод основан на объединении результатов гомологичного моделирования общей пространственной структуры белка и структуры хромофора, установленной экспериментально при помощи масс-спектрометрии. Предложенный подход может быть использован для определения пространственной структуры трудно кристаллизующихся гомологов GFP.

Ключевые слова: хромофор; хромопептид; флуоресценция; гомологичное моделирование.