ТРИТИЕВАЯ ПЛАНИГРАФИЯ. ОТЛИЧИЯ В ПРОСТРАНСТВЕННОЙ СТРУКТУРЕ БЕЛКА М1 ВИРУСА ГРИППА В КРИСТАЛЛЕ, РАСТВОРЕ И ВИРИОНЕ

^#Тел.: +7 (495) 939-72-14; факс: +7 (499) 137-83-18; e-mail: [email protected]

*Институт химической физики РАН, Москва, 119991, Косыгина, 4;
**Научно-исследовательский институт физико-химической биологии им. А.Н. Белозерского Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова, Москва

Поступила в редакцию 20.06.2011 г. Принята к печати 18.07.2011 г.

Методом тритиевой планиграфии исследована структура белка М1 вируса гриппа А/Puerto Rico/8/34 (PR8, подтип H1N1) в растворе при кислом рН и в составе вириона. Для построения моделей пространственной структуры использован специальный алгоритм, имитирующий эксперимент, а также набор алгоритмов предсказания вторичной структуры и неупорядоченных областей в белках. Третичную структуру уточняли при помощи программы Rosetta. Чтобы сравнить структуры в растворе и вирионе, использовали также данные рентгеноструктурного анализа для NM-домена. Основное различие структур белка в растворе и в кристаллическом состоянии наблюдается в области контакта N- и М-доменов, которая в кристаллическом состоянии упакована более плотно. Места максимального включения метки практически совпадают с неструктурированными областями в белке, предсказанными с помощью биоинформатического анализа. Эти области сконцентрированы в С-домене и в петлевых областях между М-, N- и С-доменами. Данные подтверждены с помощью аналитического центрифугирования и динамического светорассеяния. Обнаружены аномальные гидродинамические размеры и низкая структурированность М1-белка в растворе. Полифункциональность белка в клетке, по-видимому, связана с его пластичной третичной структурой, которая обеспечивает за счет неструктурированных областей контакт с различными молекулами-партнерами.

Ключевые слова: вирус гриппа А, белок М1, тритиевая планиграфия, моделирование пространственной структуры.