БЕЛКИ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ ФЛОЭМНЫХ ВОЛОКОН ЛЬНА
© 2012 г. Н. Н. Ибрагимова#, Н. Е. Мокшина, Т. А. Горшкова
#Тел.: +7 (843) 231-90-41; факс: +7 (843) 292-73-47; e-mail: [email protected]
Учреждение Российской академии наук Казанский институт биохимии и биофизики Казанского научного центра РАН, 420111, Казань, ул. Лобачевского, 2/31
Поступила в редакцию: 23.06.2011 г. Принята к печати: 08.07.2011.
Проведено выделение клеточной стенки из однотипных клеток – флоэмных волокон льна-долгунца (Linum usitatissimum L.), находящихся на стадии активного формирования мощной вторичной клеточной стенки. Экстрагировали слабо связанные белки клеточной стенки флоэмных волокон с последующим их разделением и получением масс-спектров. Для идентификации и установления принадлежности выявленных белков к определенному клеточному компартменту использовали разнообразные методы биоинформатики. Всего было идентифицировано 93 белка, многие из которых определены как предсказанные, предполагаемые или гипотетические. При этом 21 белок был идентифицирован как клеточно-стеночный. Отсутствие таких маркерных белков первичных клеточных стенок, как ксилоглюканэндотрансгликозилазы и экспансины, косвенно подтверждает, что в образце для экстракции белков доминировала вторичная клеточная стенка.
Ключевые слова: растительные волокна; вторичная клеточная стенка, протеом клеточной стенки; секреторные белки; биоинформатика.