ТРЕХМЕРНАЯ СТРУКТУРА ПОТЕНЦИАЛЗАВИСИМОГО ЧЕЛОВЕЧЕСКОГО КАНАЛА Kv10.2 ПО ДАННЫМ ЭЛЕКТРОННОЙ МИКРОСКОПИИ МАКРОМОЛЕКУЛ И МОЛЕКУЛЯРНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ

© 2012 г. О. С. Соколова*,**#, К. В. Шайтан*, А. В. Гризель*, А. В. Попинако*, М. Г. Карлова*, М. П. Кирпичников*

^#Тел.: +7 (495) 938-00-05; факс: +7 (495) 939-57-38; e-mail: [email protected]

*Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова, Биологический факультет 119991 Москва, Ленинские горы, д.1, стр.12;
**Институт кристаллографии РАН, 119333, Москва

Поступила в редакцию 27.06.2011 г. Принята к печати 17.08.2011 г.

Методом электронной микроскопии впервые получена трехмерная структура человеческого потенциалзависимого канала Kv10.2 с разрешением 2.5 нм. Молекула имеет четко выраженное доменное строение. Для интерпретации полученной структуры было использовано моделирование мембранной части канала Kv10.2 - по гомологии cо структурой cAMP-зависимого канала MlotiK1 (C-субъединица), цитоплазматических субдоменов PAS-PAC - по гомологии со структурой калиевого канала человека herg (A субъединица) и домена cNBD - по гомологии с каналом MloK1. Гомологичная трансмембранная часть соответствует по размерам верхней части трехмерной реконструкции. Цитоплазматические домены канала Kv10.2 образуют структуру, построенную по типу «висячей гондолы», соединенную с трансмембранной частью канала линкерами. Длина линкеров подразумевает возможность контактов между С-концевыми cNBD-доменами и N-концевыми PAS-доменами.

Ключевые слова: ионные каналы; heag2; электронная микроскопия; молекулярное моделирование.