ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ПОЛИПЕПТИДОВ КУНИТЦ-ТИПА АКТИНИИ Heteractis crispa С БОЛЕВЫМ ВАНИЛЛОИДНЫМ РЕЦЕПТОРОМ ТRPV1: IN SILICO ИССЛЕДОВАНИЕ

© 2012 г. Е.А. Зелепуга^#, В. М. Табакмахер^#, В.Е. Чаусова, М.М. Монастырная, М. П. Исаева, Э. П. Козловская

^#Тел.:+7 (423) 231-11-68; факс: +7 (423) 231-40-50; e-mail: [email protected], [email protected]

Тихоокеанский институт биоорганической химии ДВО РАН, 690022, Владивосток, просп. 100-летия Владивостока, 159

Поступила в редакцию 20.06.2011 г. Принята к печати 19.10.2011 г.

Методами молекулярной биологии установлены структуры 31 гена актинии Нeteractis crispa, кодирующие полипептиды, структурно гомологичные ингибиторам протеиназ семейства Кунитца. Установленные аминокислотные последовательности имеют точечные замены, высокую степень гомологии с последовательностями известных представителей семейства протеиназных ингибиторов типа Кунитца Н. crispa и представляют собой комбинаторную библиотеку полипептидов. Методами гомологичного моделирования генерированы их пространственные структуры. Анализ молекулярного электростатического потенциала позволил разделить данные полипептиды на три кластера. Один из кластеров включает полипептиды APHC1, APHC2 и APHC3, для которых нами ранее было показано, помимо трипсинингибирующей активности, уникальное свойство ингибировать in vitro болевой ваниллоидный рецептор TRPV1 и оказывать анальгетическое действие in vivo. В данной работе применение молекулярного докинга дало возможность установить пространственную структуру комплексов полипептидов с TRPV1, характер связывания, а также функционально значимые структурные элементы, участвующие в образовании комплекса. Полученные структурные модели позволили предложить гипотезу, объясняющую механизм воздействия полипептидов APHC1 - APHC3 на передачу болевого сигнала TRPV1-рецептором: по-видимому, происходит увеличение времени релаксации рецептора за счет связывания двух его цепей молекулой полипептида, что нарушает функционирование TRPV1 и приводит к неполному ингибированию передачи сигнала в электрофизиологических экспериментах.

Ключевые слова: комбинаторная библиотека; актиния Heteractis crispa; ингибиторы протеиназ типа Кунитца; модулирование TRPV1; молекулярный докинг.