ВЛИЯНИЕ БЕЛКОВ, СВЯЗЫВАЮЩИХСЯ С ОДНОЦЕПОЧЕЧНОЙ ДНК, НА БЕЗМАТРИЧНЫЙ/БЕСПРАЙМЕРНЫЙ СИНТЕЗ ДНК В ПРИСУТСТВИИ НИКУЮЩЕЙ ЭНДОНУКЛЕАЗЫ Nt.BspD6I

© 2012 г. Н. В. Зырина*^#, Р. И. Артюх*, И. В. Свадьбина*, Л. А. Железная*, Н. И. Матвиенко**

^#Тел.: +7(4967) 73-94-21; e.mail: [email protected]

*Учреждение Российской академии наук Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН, 142290 г. Пущино Московской обл., ул. Институтская, 3;
**Учреждение Российской академии наук Институт белка РАН

Поступила в редакцию 28.06.2011 г. Принята к печати 04.07.2011 г.

Никующая эндонуклеаза Nt.BspD6I в присутствии ДНК-полимеразы Bst стимулирует синтез ДНК в отсутствие матричной ДНК и праймера. Безматричный/беспраймерный синтез ДНК может быть одной из причин появления неспецифических продуктов во многих реакциях амплификации ДНК, особенно в реакциях, в которых используются никующие эндонуклеазы. В связи с расширением методов амплификации ДНК в присутствии никующих эндонуклеаз поиск способов ингибирования безматричного/беспраймерного синтеза ДНК становится актуальной задачей. В работе показано, что белок E.coli, связывающийся с одноцепочечной ДНК, не влияет на безматричный/беспраймерный синтез ДНК, как в отсутствие, так и в присутствии Nt.BspD6I. Белок, кодируемый геном 32 бактериофага T4, связывающийся с одноцепочечной ДНК, полностью ингибирует безматричный/беспраймерный синтез ДНК в отсутствие никующей эндонуклеазы. В присутствии никующей эндонуклеазы белок не подавляет синтез специфического продукта, но значительно уменьшает количество продуктов безматричного/беспраймерного синтеза ДНК.

Ключевые слова: синтез ДНК ab initio; безматричный/беспраймерный синтез ДНК; никующие эндонуклеазы; белки SSB; белок T4gp32; белок EcoSSB.