ФУНКЦИОНАЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ПОЛИМОРФНЫХ ИНСЕРЦИЙ Alu-РЕТРОЭЛЕМЕНТОВ ПРИ ОСТРОМ ЛИМФОБЛАСТНОМ ЛЕЙКОЗЕ

А. Ю. Комков*^,**^,#, М. А. Масчан***, В. И. Швец**, Ю. Б. Лебедев*

^#Тел: +7 (495) 330-42-88; e-mail: [email protected]

*Учреждение Российской академии наук Институт биоорганической химии имени академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН, 117997, Москва, ГСП-7, ул. Миклухо-Маклая, 16/10;
**Московский государственный университет тонких химических технологий имени М. В. Ломоносова, Москва;
***Российская детская клиническая больница, Москва

Поступила в редакцию 06.07.2011 г. Принята к печати 14.07.2011 г.

Одной из актуальных задач современной функциональной геномики, определяющей темпы развития персонифицированной медицины, является изучение индивидуальной вариабельности генома человека при различных патологических состояниях организма. В настоящей работе проведен функциональный анализ 31 полиморфной инсерции Alu-ретроэлементов в интронах генов человека при остром лимфобластном лейкозе (ОЛЛ). Показано аллель-специфичное снижение содержания первичных транскриптов генов для 21 интронной инсерции Alu-элементов. Сильно выраженным ингибиторным эффектом на транскрипцию аллеля в одноядерных клетках крови здоровых доноров и В-лимфобластах пациентов с ОЛЛ обладают 10 инсерциями. Частоты встречаемости аллелей, несущих две из таких инсерций в гене MEF2C и одну в гене TAX1BP1, значимо различаются в выборках здоровых доноров и доноров с ОЛЛ. На примере гена TARBP1 показано влияние интронной инсерции Alu на уровень зрелой мРНК в клетке.

Ключевые слова: геном человека, инсерционный полиморфизм, Alu-ретроэлементы, транскрипция, острый лимфобластный лейкоз.