ОЛИГОМЕРИЗАЦИЯ САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКОЙ НИКАЗЫ bspD6I ПРИ ПОВЫШЕННЫХ КОНЦЕНТРАЦИЯХ БЕЛКА

© 2012 г. С. А. Секерина*, А. В. Гришин*, А. Ю. Рязанова*, Р. И. Артюх**, Е. А. Рогулин**, А. К. Юнусова**, Т. С. Орецкая*, Л. А. Железная**, Е. А. Кубарева*^#

^#Тел.: +7 (495) 939-54-11; факс: +7 (495) 939-31-81; e-mail: [email protected]

*Химический факультет, факультет биоинженерии и биоинформатики и Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А. Н. Белозерского Московского государственного университета имени М. В. Ломоносова, 119991, г. Москва, Ленинские горы, д. 1;
**Институт теоретической и экспериментальной биофизики Российской академии наук, 142290, г. Пущино Московской обл., ул. Институтская, д. 3

Поступила в редакцию: 12.10.2011 г. Принята к печати: 30.01.2012 г.

Исследована способность сайт-специфической никазы BspD6I (Nt.BspD6I) образовывать олигомерные формы при концентрациях белка ≥0.5мкМ (≥0.035 мг/мл). С помощью электрофоретических исследований в присутствии или в отсутствие ДНК выявлено существование трех форм Nt.BspD6I. Оценка молекулярной массы позволила идентифицировать их как мономер, димер и тример. Показано, что димер и мономер Nt.BspD6I гидролизуют ДНК-субстрат с одинаковой специфичностью. Расчет электростатического потенциала поверхности глобулы Nt.BspD6I свидетельствует о том, что молекула белка является ярко выраженным диполем. Возникновение олигомерных форм Nt.BspD6I, по-видимому, является результатом ионных белок-белковых взаимодействий.

Ключевые слова: эндонуклеазы рестрикции; сайт-специфическая никаза, олигомеризация; белковый докинг.

Биоорг.химия 2012, 38 (4): 431-438