2’-МОДИФИЦИРОВАННЫЕ ПРОИЗВОДНЫЕ РНК, СОДЕРЖАЩИЕ 1,2-ДИОЛЬНЫЕ И АЛЬДЕГИДНЫЕ ГРУППИРОВКИ. СИНТЕЗ И ИЗУЧЕНИЕ СВОЙСТВ

© 2012 г. Е. А. Хомякова*, Е. М. Зубин*, Л. В. Павлова**, Е. В. Казанова***, И. П. Смирнов****, Г. Е. Позмогова****, С. Мюллер*****, Н. Г. Долинная*, Е. А. Кубарева*, Р. К. Хартман**, Т. С. Орецкая*^#

^#Тел.: +7 (495) 939-54-11; факс: +7 (495) 939-31-81; e-mail: [email protected]

* Химический факультет и НИИ физико-химической биологии имени А. Н. Белозерского МГУ имени М. В. Ломоносова, 119991, Москва, Ленинские горы, 1;
** Университет имени Филиппа, 35037, Марбург, Германия;
*** Информационный центр по науке и технологии, Москва;
**** ФГУ НИИ физико-химической медицины ФМБА России, Москва;
***** Университет имени Эрнста Морица Арндта, 17487, Грайфсвальд, Германия

Поступила в редакцию: 03.10.2011 г. Принята к печати: 25.11.2011 г.

Олигорибонуклеотиды, в которых виц-диольная группировка с помощью линкера присоединена к C2’-атому углеводного фрагмента нуклеотидного остатка, синтезированы с использованием 3’-амидофосфита защищенного производного 2’-O-[2-(2,3-дигидроксипропил)амино-2-оксоэтил]уридина. Показано, что встраивание в олигонуклеотидную цепь модифицированных остатков уридина не влияет существенно на стабильность РНК-РНК- и смешанных РНК-ДНК-дуплексов. Окисление диольной группы периодатом натрия позволяет получать реакционноспособные 2’-производные олигонуклеотидов с альдегидной группировкой. Изучена возможность их использования для аффинной модификации РНК-узнающих белков на примере бактериальной рибонуклеазы Р (РНКазы Р).

Ключевые слова: модифицированные олигорибонуклеотиды; аффинная модификация; РНК-белковые взаимодействия; бактериальная рибонуклеаза Р.

Биоорг.химия 2012, 38 (5): 555-568