АФФИННЫЙ ЗАХВАТ ЗАДАННЫХ ФРАГМЕНТОВ ДНК С ПОМОЩЬЮ КОРОТКИХ СИНТЕТИЧЕСКИХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ

© 2013 г. В. С. Михайлов*, В. К. Потапов*, Р. Н. Амирханов**^, ***, Н. В. Амирханов**^, ***, С. С. Буланенкова*, С. Б. Акопов*, В. Ф. Зарытова**^, ***, Л. Г. Николаев*^#, Е. Д. Свердлов*

^#Тел.: +7(495)330-70-29; факс: +7(495)330-65-38; e-mail: [email protected]

*Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Москва, 117997, Москва, В-437, ул. Миклухо-Маклая,16/10;
**Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, 630090, Новосибирск, пр. акад. Лаврентьева, 8;
***Новосибирский государственный университет, 630090, Новосибирск

Поступила в редакцию: 26.06.2012 г. Принята к печати: 06.07.2012 г.

Сравнивали способность коротких олигомеров пептидо-нуклеиновой кислоты и олигонуклеотидов, содержащих модифицированные остатки 5-метилцитидина, 2-аминоаденозина и 5-пропинил-2'-дезоксиуридина (SBO), обладающих повышенным сродством к комплементарной нуклеотидной последовательности, производить аффинный захват целевого двунитевого фрагмента ДНК c такой последовательностью одной из цепей из смеси фрагментов по механизму концевой инвазии. Оба типа зондов в подобранных условиях показали высокую эффективность отбора. Зонды на основе SBO могут представлять собой более доступную и простую в приготовлении альтернативу ПНК для этих целей.

Ключевые слова: ДНК, аффинный захват; пептидо-нуклеиновая кислота; strong binding oligonucleotide (SBO).

Биоорг.химия 2013, 39 (1): 81-86