ОЛИГО(2'-О-МЕТИЛРИБОНУКЛЕОТИДЫ) И ИХ ПРОИЗВОДНЫЕ. IV. КОНЪЮГАТЫ ТРИПЛЕКСФОРМИРУЮЩИХ ОЛИГО(2'-O-МЕТИЛРИБОНУКЛЕОТИДОВ) С ЛИГАНДАМИ МАЛОЙ БОРОЗДКИ И ИНТЕРКАЛЯТОРАМИ: СИНТЕЗ, СВОЙСТВА И ПРИМЕНЕНИЕ

^#Тел.: (383) 363-51-29; факс: (383) 363-51-53; e-mail: [email protected]

*Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Российская Федерация, 630090 Новосибирск, просп. Лаврентьева 8;
**Национальный музей естественной истории (MNHN), 75231 Париж, Франция, ул. Кювье 57, BP 26, CNRS UMR 7196, INSERM U565

Поступила в редакцию 29.02.2012 г. Принята к печати 15.05.2012 г.

Синтезированы 3'-защищённые конъюгаты триплексформирующих пиримидиновых олиго(2'-О-метилрибонуклеотидов), содержащие на 5'-конце лиганды малой бороздки ДНК (MGB), связанные со специфически стабилизирующим тройную спираль интеркалятором на основе бензоиндолохинолина (BIQ). Такие конъюгаты образуют стабильные комплексы c дцДНК-мишенью за счёт одновременного связывания с ее большой и малой бороздками и интеркаляции BIQ. Определены константы диссоциации и термическая стабильность комплексов конъюгатов с модельной дцДНК-мишенью, соответствующей полипуриновой последовательности генов nef и pol провируса иммунодефицита человека (ВИЧ-1). Показано, что введение MGB и интеркалятора значительно повышает стабильность комплексов олиго(2'-О-метилрибонуклеотидов) с дцДНК-мишенью при рН 7.2 и 37ºС. Введение интеркалятора ускоряет также процесс формирования комплекса конъюгата с дцДНК-мишенью. В системе транскрипции in vitro с использованием в качестве матрицы 780-звенного фрагмента ДНК, содержащего в транскрибируемой области промотор фага Т7 и модельный полипуриновый участок, продемонстрировано зависимое от дозы ингибирование транскрипции конъюгатами олиго(2'-О-метилрибонуклеотидов) с лигандами малой бороздки ДНК и интеркалятором.

Ключевые слова: олиго(2'-О-метилрибонуклеотиды), конъюгаты; лиганды малой бороздки; интеркалятор; триплексы ДНК, ингибирование транскрипции in vitro.