СЫВОРОТОЧНЫЙ АЛЬБУМИН: ПОИСК НОВЫХ САЙТОВ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ С ФОСФОРОРГАНИЧЕСКИМИ СОЕДИНЕНИЯМИ НА ПРИМЕРЕ ЗОМАНА
© 2014 г. Д. А. Белинская*, #, В. И. Шмурак**, Д. С. Прокофьева**, Н.В. Гончаров*, **
#Тел.: +7 (921) 580-69-19, +7 (812) 552-32-56; e-mail: [email protected]
*ФГБУН Институт эволюционной физиологии и биохимии им. И.М. Сеченова РАН, 194223 Россия, Санкт-Петербург, проспект Тореза 44; **ФГУП "НИИ гигиены, профпатологии и экологии человека" ФМБА России, Санкт- Петербург
Поступила в редакцию 17.02.2014. Принята к печати 02.04.2014.
Известно, что альбумин может взаимодействовать с фосфорорганическими соединениями (ФОС). Однако окончательно не установлены остатки аминокислот альбумина, отвечающие за это взаимодействие, природа образующихся при этом связей, обсуждаются каталитические и псевдокаталитические функции альбумина. Методами молекулярного моделирования выявлены возможные сайты взаимодействия альбумина с зоманом. Структуры комплексов зомана с альбумином определяли методом молекулярного докинга, стабильность полученных комплексов рассчитывали методом молекулярной динамики. Установлено, что образование химической связи зомана с остатком тирозина-411 происходит только при условии депротонирования последнего. Другой остаток – тирозин-150 в альбумине эффективнее связывает зоман, чем остаток тирозина-411. При этом депротонирование остатка тирозина-150 не определяет эффективность в момент связывания (сорбции) зомана, а влияет на стабильность образуемой связи. Предполагается, что остатки тирозина-150 и серина-193 альбумина могут служить сайтами каталитического взаимодействия с зоманом. Выдвинута гипотеза о влиянии депротонирования остатка аминокислоты в одном сайте альбумина на инициирование связывания лиганда в другом сайте (аллостерическая регуляция) альбумина.
Ключевые слова: альбумин, зоман, молекулярный докинг, молекулярная динамика.
Биоорг. химия 2014, 40 (5): 541-549