ПРОТОТИП ОЛИГОНУКЛЕОТИДНОГО МИКРОЧИПА ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ПАТОГЕНОВ I ГРУППЫ, ОТНОСЯЩИХСЯ К СЕМЕЙСТВАМ ARENA- И FILOVIRIDAE

© 2014 г. И. В. Жирнов*, В. А. Рябинин*, А. Н. Синяков*^{, #}, В. А. Терновой**, А. Н. Шиков**

^#Тел.: (3832) 330-46-53, факс: (3832) 333-36-77; e-mail: [email protected]

*Новосибирский институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, 630 090, Новосибирск, просп. Акад. Лаврентьева, 8;
**ФГУН ГНЦ ВБ “Вектор” Роспотребнадзора, Новосибирская обл., Кольцово

Поступила в редакцию 19.02.2014 г. Принята к печати 05.03.2014 г.

Предложен прототип олигонуклеотидного микрочипа для определения вирусов Lassa, Junin, Machupo, Guanarito (семейство Arenaviridae) и вирусов Ebola и Marburg (семейство Filoviridae). Для расчeта гибридизационных зондов и праймеров был использован оригинальный подход, основанный на анализе аминокислотных последовательностей вирусных белков (нуклеокапсидного белка для вирусов Junin, Guanarito, Machupo и РНК-зависимой РНК-полимеразы для вирусов Lassa, Ebola и Marburg) с последующим перекодированием выявленных уникальных пептидов в соответствующие им наборы олигонуклеотидов.

Ключевые слова: аренавирусы, филовирусы, микрочипы, малобороздочный лиганд, диагностика.