РАЗЛИЧИЯ АКТИВНОСТИ НОНСЕНС-ОПОСРЕДОВАННОЙ ДЕГРАДАЦИИ мРНК В ЛИНИЯХ КЛЕТОК МЛЕКОПИТАЮЩИХ, ВЫЯВЛЕННЫЕ С ПОМОЩЬЮ ФЛУОРЕСЦЕНТНОГО РЕПОРТЕРА¹

^#Тел.: +7 (499) 724-81-22; e-mail: [email protected]

*ФГБУН Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, 117997, Москва, ГСП-7, ул. Миклухо-Маклая, 16/10;
**Нижегородская государственная медицинская академия, 603005, Нижний Новгород, пл. Минина и Пожарского, 10/1

Поступила в редакцию 24.03.2015 г. Принята к печати 14.04.2015 г.

Исследована активность каскада нонсенс-опосредованной деградации мРНК (nonsense_mediated mRNA decay, NMD) в нескольких культурах клеток млекопитающих. Анализ проводили с помощью недавно разработанного нами генетически кодируемого флуоресцентного сенсора [Pereverzev et al. Sci. Rep. 2015. V. 5. P. 7729]. Данный флуоресцентный NMD-репортер позволяет оценить активность NMD в единичных живых клетках по соотношению сигналов зеленого и красного флуоресцентных белков. Были проанализированы следующие клеточные линии: карцинома толстой кишки мыши CT26, карцинома легких Льюиса мыши LLC, Т-клеточный лейкоз человека Jurkat, спонтанно иммортализованная неонкогенная линия кератиноцитов человека HaCaT. Данные клеточные линии показали сильно различающуюся активность NMD. В клетках CT26 активность NMD была низкой, а в клетках LLC – высокой (в 8.5 раз выше, чем в CT26). Клетки Jurkat и HaCaT проявляли сильную гетерогенность и включали в себя две субпопуляции клеток, обладающих низкой и высокой активностью NMD. Кроме того, для первичной культуры нейронов из гиппокампа эмбрионов мыши была показана высокая активность NMD.

Ключевые слова: генетически кодируемый сенсор, NMD, флуоресцентный белок, культура клеток.

____________________
¹Статья публикуется по материалам сообщения, представленного на VII Российском симпозиуме “Белки и пептиды”; Новосибирск, 12–17 июля 2015 г.

БИООРГАНИЧЕСКАЯ ХИМИЯ, 2015, том 41, № 5, с. 587–591