ВЫБОР ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ, СЕЛЕКТИВНО СВЯЗЫВАЮЩИХ ОНКОГЕННУЮ miR-21¹

^#Тел.: +7 (383) 363-51-61; факс: +7 (383) 363-51-53; эл. почта: [email protected]

ФГБУН Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, 630090, Новосибирск, просп. акад. Лаврентьева, 8

Поступила в редакцию 15.06.2016 г. Принята к печати 29.06.2016 г.

Разработана серия антисмысловых олигонуклеотидов, нацеленных на онкогенную малую некодирующую РНК miR-21, с целью ее селективного связывания, и исследованы закономерности взаимодействия miR-21 с этими олигонуклеотидами in vitro. В серию входили линейные и шпилечные олигонуклеотиды с длиной антисмыслового фрагмента 10–16 нт, комплементарного как 5'-, так и 3'-области молекулы miR-21. Шпилечные олигонуклеотиды состояли из последовательности, комплементарной miR-21, и шпильки, включающей четырехзвенную петлю и стебель длиной 6–9 п.о., необходимый для стабилизации комплекса с miR-21. Показано, что включение в состав олигонуклеотида шпильки с длиной стебля 6 п.о. приводит к выигрышу в эффективности связывания с miR-21 в 1.6 раз по сравнению с линейным олигонуклеотидом, а удлинение стебля шпильки с 6 до 9 п.о. не повышает эффективность связывания. Шпилечные олигонуклеотиды с длиной антисмыслового фрагмента 14 нт эффективно связываются с miR-21 и не уступают 16-звенным линейным и шпилечным олигонуклеотидам по эффективности комплексообразования. В результате исследований показано, что шпилечные олигонуклеотиды с длиной антисмыслового фрагмента 14 нт и шпилькой, включающей стебель длиной 6 п.о., являются оптимальными для селективного и эффективного связывания зрелой miR-21.

Ключевые слова: онкогенная микроРНК, антисмысловой олигонуклеотид, эффективность связывания, анти-микроРНК терапия.

__________________

¹Статья публикуется по материалам сообщения, представленного на конференции “Химическая биология-2016”; г. Новосибирск, 24–29 июля 2016 г.

Биоорг. химия 2017, 43 (1): 35-44