КОЛЬЦЕВЫЕ РНК ФОРМЕННЫХ ЭЛЕМЕНТОВ, ПЛАЗМЫ И СУБФРАКЦИЙ ПЛАЗМЫ КРОВИ ЧЕЛОВЕКА¹

© 2017 г. А. В. Савельева^#, Д. Н. Барякин, В. В. Морозов, Е. В. Кулигина, В. А. Рихтер, Д. В. Семенов

^#Тел.: +7 (383) 363-51-89; эл. почта: [email protected]

Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Россия, 630090, г. Новосибирск, пр. ак. Лаврентьева, 8

Поступила в редакцию 15.06.2016 г. Принята к печати 04.08.2016 г.

DOI: 10.7868/S0132342317020166

Кольцевые РНК – новый класс регуляторных некодирующих РНК с замкнутой структурой рибозофосфатного остова. В работе проведен поиск индикаторных последовательностей кольцевых pol II-транскриптов в массивах данных высокоэффективного секвенирования РНК форменных элементов, плазмы и субфракций плазмы крови человека. Идентифицировано 88 индикаторных соединений экзонов кольцевых РНК, из которых 8 представляют собой фрагменты новых, не аннотированных ранее кольцевых транскриптов человека. Набор выявленных 88 кольцевых РНК крови человека обогащен продуктами генов, кодирующих транскрипционные факторы, а также белки, участвующие в процессах биогенеза и транспорта мембранных везикул. ОТ-ПЦР-анализ распределения кольцевых РНК в субфракциях плазмы крови человека показал, что полноразмерные кольцевые транскрипты детектируются преимущественно во фракциях мембранных частиц плазмы крови, таких как микровезикулы и экзосомы. Полученные результаты в совокупности с данными литературы позволяют заключить, что циркулирующие кольцевые РНК являются регуляторами фундаментальных клеточных процессов и могут быть использованы для разработки новых подходов малоинвазивной диагностики заболеваний человека.

Ключевые слова: внеклеточные РНК, длинные некодирующие РНК, кольцевые РНК, микровезикулы, РНК плазмы крови человека, экзосомы.

Биоорг. химия 2017, 43 (2): 133-145

________________________

¹Статья публикуется по материалам сообщения, представленного на конференции “Химическая биология-2016”; г. Новосибирск, 24–29 июля 2016 г.