НУКЛЕОТИДНАЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ ГЕНОМА ШТАММА L2 ВИРУСА ПРОСТОГО ГЕРПЕСА ПЕРВОГО ТИПА

© 2017 г. М. Ю. Скоблов*^, **, А. В. Лавров*^, ***, А. Г. Брагин****, Д. А. Зубцов**, В. Л. Андронова*****, Г. А. Галегов*****, Ю. С. Скоблов******^{, #}

^#Тел.: +7 (495) 336-26-41, эл. почта: [email protected]

*Медико-генетический научный центр, Москва, 115478, Россия;
**Московский институт физики и технологии, Долгопрудный, Московская обл., 141700, Россия;
***Кафедра молекулярной и клеточной генетики, Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования “Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова”, Москва, Россия;
****Лаборатория Парсек, Санкт-Петербург, Россия;
*****Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского Федерального государственного бюджетного учреждения “Федеральный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф. Гамалеи” Минздрава РФ, Москва, 123098, Россия;
******Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Россия, 117997, Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10

Поступила в редакцию 25.02.2016 г. Принята к печати 23.03.2016 г.

DOI: 10.7868/S0132342316060142

Нуклеотидная последовательность генома эталонного штамма L2 вируса простого герпеса первого типа получена с использованием технологии полногеномного секвенирования. Для сборки генома вируса было осуществлено 402444 чтений со средней длиной 202 нт – это соответствует 524-кратному покрытию генома вируса. Полученные данные удалось собрать в 52 контига с N50-4518, суммарная длина контигов 120929 нт. Полученная последовательность была депонирована в GenBank.

Ключевые слова: вирус простого герпеса типа 1, полногеномное секвенирование.

Биоорг. химия 2017, 43 (2): 163-166