5'-БИСПИРЕНИЛЬНЫЕ ЗОНДЫ ТИПА “МОЛЕКУЛЯРНЫЙ МАЯК” ДЛЯ ДЕТЕКЦИИ РНК

^#Тел.: +7 (383) 363-51-29; факс: +7 (383) 363-51-53; эл. почта: [email protected]

*Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, 630090, г. Новосибирск, просп. акад. Лаврентьева, 8;
**Институт цитологии и генетики СО РАН, 630090, г. Новосибирск, просп. акад. Лаврентьева, 10

Поступила в редакцию 05.07.2016 г. Принята к печати 15.08.2016 г.

DOI: 10.7868/S0132342317030095

Cозданы новые флуоресцентные 5'-биспиренильные зонды типа “молекулярный маяк”, действие которых основано на увеличении эксимерной флуоресценции пирена при взаимодействии с РНК-мишенью. Зонды представляют собой олиго(2'-О-метилрибонуклеотиды), частично комплементарные 28S рРНК, содержащие биспиренильную группировку на 5'-конце и тушитель флуоресценции BHQ1 на 3'-конце. Проведено сравнительное исследование флуоресценции зондов, различающихся расстоянием биспиренильной группировки от РНК-мишени после образования гибридизационного комплекса. Наибольшей эксимерной флуоресценцией при связывании с комплементарной 43-звенной РНК-мишенью обладают зонды, 5'-биспиренильная группировка которых располагается в непосредственной близости от дуплекса, а не на “свисающем” конце. Продемонстрирована возможность визуализации 28S рРНК в клетках с использованием разработанных нами зондов, что свидетельствует об их перспективности в качестве высокоселективных инструментов детекции РНК.

Ключевые слова: олиго(2'-О-метилрибонуклеотиды), флуоресцентные зонды, биспиренильная группировка, молекулярный маяк, детекция РНК.

Биоорг. химия 2017, 43 (3): 261-272