Мини-обзор
БИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНЫЕ ПЕПТИДЫ, КОДИРУЕМЫЕ КОРОТКИМИ ОТКРЫТЫМИ РАМКАМИ СЧИТЫВАНИЯ
© 2017 г. Р. А. Хазигалеева#, И. А. Фесенко
#Тел.: +7 (916) 171-75-82; эл. почта: [email protected]
ФГБУН Институт биоорганической химии имени академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, 117997, Россия, Москва, ГСП-7, улица Миклухо-Маклая, 16/10
Поступила в редакцию 07.12. 2016 г. Принята к печати 27.03.2017 г.
DOI: 10.7868/S013234231706001X
Сотни тысяч коротких открытых рамок считывания (кОРС), потенциально способных кодировать пептиды до 100 а.о., обнаружены в геномах всех живых организмов. Известные пептиды, кодируемые кОРС выполняют важные функции, такие как регуляция морфогенеза у насекомых, контроль эмбриогенеза у рыб, участие в процессе образования азотфиксирующих клубеньков у растений и ряд других. Однако кодирующий потенциал большинства кОРС, а также количество таких пептидов в клетках практически неизвестно. Системный подход, основанный на использовании биоинформатических алгоритмов, а также транскрипционного и протеомного профилирования, позволяет идентифицировать кОРС и проанализировать их кодирующий потенциал. В обзоре затронуты вопросы транскрипции и трансляции кОРС в клетках, особенности их поиска и идентификации, а также анализа биологических функций.
Ключевые слова: биоактивные пептиды, короткие открытые рамки считывания (кОРС).
Биоорг. химия 2017, 43 (6): 588-597