A STUDY ON IMMONIUM IONS AND IMMONIUM-RELATED IONS DEPENDING ON DIFFERENT COLLISION ENERGIES AS ASSESSED BY Q-TOF MS 1
© 2018 C. Guo, X. F. Guo#, L. Zhao, D. D. Chen, J. Wang, and J. Sun
#E-mail: [email protected]
State Forestry Administration Key Open Laboratory, International Centre for Bamboo and Rattan, Beijing, 100102 China
Поступила в редакцию 22.08.2017 г. Принята к печати 06.02.2018 г.
DOI: 10.1134/S0132342318040231
Изучение иммониевых ионов и их производных в зависимости от энергии столкновения с помощью квадрупольной время-пролeтной масс-спектрометрии. Иммониевые ионы и их производные присутствуют в масс-спектрах ионов-предшественников пептидов. Общее понимание вариабельности относительного содержания таких ионов способствует идентификации неизвестных пептидов. В данной работе четыре пептида, получаемые при масс-спектрометрии (МС) фосфорилазы сахарозы, были выбраны в качестве ионов-предшественников; частоты встречаемости иммониевых ионов и их производных были определены на наборе из 130 спектров МС/МС. Показано, что иммониевые ионы и их производные, в основном, образуются при дальнейшей фрагментации а-, b- и y-ионов. При оптимальной энергии столкновений (ЭС), иммониевые ионы лейцина с m/z 86, изолейцина с m/z 86, глутамина с m/z 101, аргинина с m/z 129, триптофана с m/z 159, пролина с m/z 70, валина с m/z 72, глутаминовой кислоты с m/z 102, фенилаланина с m/z 120 и тирозина с m/z 136, а также производные иммониевых ионов метионина с m/z 61, лизина с m/z 84, глутамина с m/z 84 и тирозина с m/z 91 присутствовали в спектрах с высокой частотой и c достаточно высокой доверительной вероятностью, что предполагает присутствие соответствующих аминокислот. Однако иммониевые ионы серина с m/z 60 и треонина с m/z 74 встречались редко, но были стабильны при высоких ЭС и характеризовались высокими значениями доверительной вероятности, указывая на наличие остатков серина и треонина соответственно. Иммониевые ионы аспарагина с m/z 87 также служили надeжным показателем присутствия остатков аспарагина.
Ключевые слова: фосфорилаза сахарозы, смесь белков, иммониевые ионы, производные иммониевых ионов, аминокислота, диссоциация, индуцируемая столкновениями (ДИС). _____________________
1 Полный текст статьи печатается в английской версии.
Биоорг. химия 2018, 44 (4): 407-407