МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЧЕСКОЕ ОПРЕДЕЛЕНИЕ АМИНОКИСЛОТНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ КОРОТКИХ И СРЕДНИХ ПЕПТИДОВ В СИСТЕМЕ ESI-o-TOF ВМЕСТО МС/МС. 2. ИЗБИРАТЕЛЬНАЯ ФРАГМЕНТАЦИЯ ДАНСИЛИРОВАННЫХ ПЕПТИДОВ С ПРЕИМУЩЕСТВЕННЫМ ОБРАЗОВАНИЕМ b-ИОНОВ ¹

^#Эл. почта: [email protected]

*Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Россия, 117997, ГСП-7, Москва, В-437, ул. Миклухо-Маклая, 16/10;
**Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт аналитического приборостроения РАН, Россия, 198095, Санкт-Петербург, ул. Ивана Черных, 31-33, лит. А

Поступила в редакцию 07.05.2018 г. После доработки 15.07.2018 г. Принята к публикации 05.09.2018 г.

DOI: 10.1134/S0132342319010111

Предложена схема анализа масс-спектров фрагментных пептидов, включающая химическую модификацию N-концевой аминогруппы пептида 5-(N,N-диметиламино)нафтален-1-сульфонилхлоридом с последующей ионизацией дансилированного пептида методом электрораспыления и его фрагментацией в зоне низкого вакуума узла ввода раствора образца в масс-спектрометр (cхема ESI-о-TOF). Показано, что получаемые ионы фрагментируются с преимущественным образованием b-ионов, содержащих Dns-группу. Указанным способом удается получить высокоинтенсивные b-ионы (соотношение интенсивности пик/фон: 10/1–100/1), в том числе особенно ценные для расшифровки структуры b₁- и b₂-ионы. В сочетании с предложенным ранее способом получения информативных y-ионов указанный подход позволяет достоверно определять полную аминокислотную последовательность пептидов, содержащих до 10 а.о., без использования компьютерных программ анализа фрагментного состава пептидов.

Ключевые слова: пептиды, дансилирование, сиквенс, ESI-o-TOF, b-ионы
___________________
¹ Сообщение 1 см. Назимов И.В., Бубляев Р.А. // Биоорган. химия. 2018. Т. 44. № 5. C 481–491. [Bublyaev R. A. // Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 2018. V. 44. P. 481–491.]

Биоорг. химия 2019, 45 (2): 136-144